Wanneer u een bestand verwijdert, blijft het nog enige tijd op uw harde schijf staan en zal het pas volledig van de schijf verdwijnen wanneer het door een nieuw bestand wordt vervangen, wat enige tijd kan duren.
Met de hulp van specifieke software kunnen bestanden worden hersteld. Met dit programma verwijdert u het bestand volledig. Zeer handig in geval van virussen die niet volledig kunnen worden verwijderd.
Clean Disk Security maakt het ook mogelijk om het swap-bestand van Windows schoon te maken, onnodige tijdelijke bestanden van de schijf te verwijderen, zoals tijdelijke bestanden van browsers, de lijst met "recente bestanden" op te schonen en andere schoonmaakopties.