Fan Control Portable là phiên bản có thể chạy của Fan Control không cần cài đặt và có thể được mở trực tiếp từ một chiếc USB hoặc thư mục riêng biệt. Phiên bản này giữ nguyên các tính năng có trong phiên bản tiêu chuẩn, cho phép điều chỉnh hành vi của quạt theo dữ liệu nhiệt độ được cung cấp bởi các cảm biến của CPU, GPU, bo mạch chủ và các thành phần khác được hệ thống giám sát.
Chương trình cho phép tạo các đường cong tốc độ tùy chỉnh, thiết lập các hồ sơ riêng biệt cho các tình huống khác nhau và chuyển đổi giữa chúng khi cần thiết. Nó cũng cho phép kết hợp nhiều cảm biến trong cùng một đường cong, thiết lập giới hạn tối thiểu hoặc tối đa và áp dụng phản ứng nhanh hơn hoặc nhẹ nhàng hơn với các biến động nhiệt độ. Các đường cong có thể được lưu, tải và chỉnh sửa theo nhu cầu.
Fan Control Portable bảo tồn hỗ trợ cho nhiều bộ điều khiển PWM, các bộ điều khiển tích hợp trên bo mạch chủ, quạt GPU tương thích và các thiết bị bổ sung được nhận diện thông qua các plugin. Phiên bản di động cũng hỗ trợ các mô-đun cộng đồng, tiện ích mở rộng và các cảm biến bổ sung, miễn là được đặt trong các thư mục tương ứng trong thư mục của chương trình.
Sự di động giúp công việc bảo trì trên các máy tính khác nhau dễ dàng hơn, cho phép cấu hình quạt một cách tạm thời mà không làm thay đổi hệ thống hoặc để lại các tệp rải rác. Kỹ thuật viên và người dùng nâng cao có thể chuyển giao các hồ sơ tùy chỉnh, điều chỉnh quá trình làm mát cho các máy khác nhau và thực hiện các bài kiểm tra nhanh về hành vi nhiệt mà không cần phần mềm vẫn được cài đặt sau khi sử dụng.