Mit der Popularität von USB-Sticks kamen auch die Viren dieser Art von Geräten, die immer häufiger werden und für das Entsetzen aller sorgen. Diese Art von Virus nutzt in der Regel die AutoRun-Funktion und führt die Dateien automatisch aus, sobald das Gerät vom Windows erkannt wird.
Der USB Doctor schützt die wichtigsten Dateien und Ordner, die von Viren dieser Art genutzt werden, nämlich die autorun.inf und den Ordner recycler.