Cùng với sự phổ biến của pendrives, virus từ loại thiết bị này đã trở nên ngày càng phổ biến, gây ra sự hoang mang cho mọi người. Loại virus này thường sử dụng tính năng AutoRun và tự động thực thi các tệp tin ngay khi thiết bị được phát hiện bởi Windows.
USB Doctor bảo vệ các tệp tin và thư mục chính được sử dụng bởi loại virus này, đó là autorun.inf và thư mục recycler.