Tillsammans med populariseringen av pendrives kom virus av denna typ som har blivit allt vanligare till förtvivlan för alla. Denna typ av virus använder vanligtvis AutoRun-funktionen och kör automatiskt filerna när enheten upptäcks av Windows.
USB Doctor skyddar de viktigaste filerna och mapparna som används av virus av detta slag, som autorun.inf och mappen recycler.