Wraz z popularyzacją pendrive'ów pojawiły się wirusy tego typu, które stają się coraz bardziej powszechne, ku przerażeniu wszystkich. Tego rodzaju wirus zazwyczaj wykorzystuje funkcję AutoRun i automatycznie uruchamia pliki w momencie, gdy urządzenie zostaje wykryte przez Windows.
USB Doctor chroni główne pliki i foldery wykorzystywane przez wirusy tego typu, którymi są autorun.inf i folder recycler.